Veškerá nastavení mapy, legend datových zdrojů, tabulek , relací a ostatních objektů aplikace Gisel jsou součástí "projektu". Projekt je základní dokument uživatele pracujícího s aplikací. Jeden projekt může sdílet více uživatelů, a současně může jeden uživatel využívat více projektů. Do aktuálního projektu je možné vkládat další projekty a vytvářet tak složitější celky.